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2.4 两组小鼠肠道菌群 Beta 多样性指数组间差异分 丰度高于 DZ 组,差异有统计学意义(P 均 <0.05),见
析 PCoA 图显示,MX 组与 DZ 组样本基本上分别聚 图 7。
集在不同的象限,相距较远,样本间多样性差异较大 在属水平,共有 27 类菌的丰度在两组小鼠肠道菌
(t=22.444,P=0.004),见图 5。 群内有差异(P 均 <0.05)。丰度较高的前 10 位肠道菌
2.5 两组小鼠肠道菌群组间差异物种分析 群:MX 组普雷沃菌科 _UCG-003(Prevotellaceae_UCG-
2.5.1 两组小鼠肠道菌群组间与组内差异性分析 003)、拟杆菌属(Bacteroides)、毛螺菌科 NK4A136
Anosim 相似性分析结果显示,两组小鼠肠道菌群差 组(Lachnospiraceae_NK4A136_group)、 瘤 胃 球 菌 属
异组间大于组内,差异有统计学意义(R=0.476, (Ruminococcus)、普雷沃菌科 _UCG-001(Prevotellaceae_
P=0.001),见图 6。 UCG-001)、普雷沃菌属(Prevotella)、大肠埃希菌
2.5.2 肠道菌群差异物种分析 在门水平,MX 组未明 (Colidextribacter)、毛螺菌科 _UCG-006(Lachnospiraceae_
确细菌(Unidentified_ Bacteria)、蓝细菌(Cyanobacteria)、 UCG-006)丰度高于 DZ 组,罗姆布茨菌(Romboutsia)、
易感微生物(Elusimicrobia)、弯曲杆菌(Campilobacterota) 土杆菌属(Turicibacter)丰度低于 DZ 组,差异有统计
学意义(P<0.05),见图 8。
2.5.3 两组小鼠肠道菌群 LEfSe 分析 LEfSe 分析结果
显示,两组共有 21 种肠道菌群丰度有差异,其中梭状
芽孢杆菌纲(Clostridia)、普雷沃菌科(Prevotellaceae)、
1 000 MX1
MX2
MX3
MX4
MX5
MX6
MX7
800 MX8
MX9
MX10
DZ1
DZ2
DZ3
DZ4
DZ5
600
DZ6
OTU 数量 DZ8
DZ7
DZ9
DZ10
图 2 两组小鼠肠道菌群 Venn 图 400
Figure 2 Venn diagram of intestinal flora between two groups of mice
1.00 200
其他
酸杆菌门
0.75 蓝细菌 0
绿弯菌门
放线菌门
脱硫菌门 0 10 000 20 000 30 000 40 000
未明确细菌 A 序列数据量
疣微菌门
相对丰度 0.50 拟杆菌门
变形菌门
厚壁菌门
0.25 600 MX 组
DZ 组
500
0
MX 组 DZ 组
组别 400
图 3 两组小鼠肠道菌群门水平物种相对丰度柱状图
Figure 3 Relative abundance of species at phylum level intestinal flora of 观察物种数 300
mice between two groups
200
表 1 两组小鼠肠道菌群 Shannon 指数比较( ±s)
Table 1 Shannon Diversity Index analysis of intestinal flora between two 100
groups of mice
组别 只数 Shannon 指数 0
DZ 组 10 5.807±0.461 0 10 000 20 000 30 000 40 000
B
MX 组 10 4.549±1.450 序列数据量
注:A 为按样品分析物种稀释曲线,B 为按组分析物种稀释曲线;
t 值 2.614
OTU= 分类操作单元
P 值 0.024 图 4 两组小鼠菌群物种稀释曲线
注:DZ 组 = 对照组,MX 组 = 模型组 Figure 4 Rarefaction curve of intestinal flora between two groups of mice