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              注:A 表示生物过程,B 表示细胞成分,C 表示分子功能;GO Circle 图的内环是条形图,其中条形高度表示 GO 术语(P 值)的重要性,颜
           色表示 Z 值大小,外环显示了每组基因表达水平(LogFC)的散点图,蓝点代表下调基因,红点代表上调基因;GO= 基因本体论,BP= 生物过程,
           CC= 细胞成分,MF= 分子功能
                                               图 2 CRPC 的 DEGs GO 富集分析结果
                            Figure 2 GO enrichment results of differentially expressed genes in castration-resistant prostate cancer

                                                                        表 3 CRPC 的 DEGs 主要参与的分子功能
           与黏着斑、PI3K-Akt信号通路和细胞周期等途径(图3)。
                                                               Table 3 Major molecular functions of differentially expressed genes
           2.3 CRPC 的 DEGs PPI 分析及关键基因筛选 应用                    involved in castration-resistant prostate cancer development
           STRING 数据库对筛选出的 279 个 DEGs 进行 PPI 分析,                          ID                     描述
           通过移除分离和单独连接的节点,应用 Cytoscape 将蛋                              GO:0005201           细胞外基质结构成分
           白网络可视化,得到一个由 224 个节点和 1 665 条边组                             GO:0005515              蛋白质结合
                                                                       GO:0005518            胶原蛋白质结合
           成的 PPI 网络(图 4A)。使用 MCODE 识别出了最重
                                                                       GO:0050840            细胞外基质结合
           要的模块(分数 =42.093),由 43 个节点和 863 条边组
                                                                       GO:0005178              整合素结合
           成(图 4B)。根据筛选条件共鉴定出 15 个关键基因(图
                                                                       GO:0008307             肌肉结构成分
           4C), 分 别 是 CDC20、CCNB2、PRC1、MAD2L1、                         GO:0048407         血小板衍生生长因子结合
           PBK、NUSAP1、RRM2、SMC2、MELK、KIF4A、                            GO:0019901             蛋白激酶结合
           DTL、ZWINT、CEP55、RACGAP1 和 CDKN3(表 4)。                       GO:0008201               肝素结合
           2.4 关键基因与 CRPC 患者预后的关系 对 15 个关                              GO:0051015            肌动蛋白丝结合
           键基因进行生存分析,结果显示,CDC20(n=245)、
           MAD2L1(n=246)和 NUSAP1(n=246)高表达组 CRPC                    PI3K-Akt 信号通路
           总生存期分别短于 CDC20(n=245)、MAD2L1(n=246)                              黏着斑                          -lgp 值
           和 NUSAP1(n=246)低表达组,差异均有统计学意义
                                                               细胞外基质受体相互作用                                 8
           (P=0.049,P=0.035,P=0.020), 见 图 5。CDC20、                                                         6
           MAD2L1 和 NUSAP1 高表达组 CRPC 无病生存期分别短                              阿米巴病                            4
           于 CDC20、MAD2L1 和 NUSAP1 低表达组,差异均有统                               吞噬体                            2
           计学意义(P=7.5E-05,P=0.043,P=0.002),见图 6。                                                      KEGG
                                                                      蛋白质消化吸收                            基因数量
           绘 制 CDC20、MAD2L1 和 NUSAP1 预 测 CRPC 发 生 的                                                        5.0
                                                                           细胞周期
           ROC 曲线,结果显示,AUC 分别为 0.933、0.762、0.950                                                           7.5
                                                                                                           10.0
           (图 7)。                                                   卵母细胞减数分裂                               12.5
           3 讨论                                                             百日咳                            15.0
               CRPC 发病机制复杂,AR 扩增、AR 突变及 AR 变
                                                                              疟疾
           异等多种机制均参与 CRPC 的发生、发展               [23] ,但具体
                                                                                    0.050  0.075  0.100
           机制仍难以明确。本研究采用生物信息学方法分析芯片                                                      基因率
           数据集共筛选出 279 个 DEGs,通过 GO 和 KEGG 富集                     注:KEGG= 京都基因和基因组百科全书
           分析发现 DEGs 主要富集于细胞分裂、有丝分裂和细胞                                  图 3 CRPC 的 DEGs KEGG 富集分析结果
                                                               Figure 3 KEGG enrichment results of differentially expressed genes
           周期。已有研究表明,有丝分裂停滞可抑制 CRPC 的进                         involved in castration-resistant prostate cancer development
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