Chinese General Practice ›› 2022, Vol. 25 ›› Issue (24): 3022-3028.DOI: 10.12114/j.issn.1007-9572.2022.0007
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Received:
2022-03-12
Revised:
2022-06-11
Published:
2022-08-20
Online:
2022-06-30
Contact:
Weihua ZHAO
About author:
通讯作者:
赵卫华
作者简介:
基金资助:
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URL: https://www.chinagp.net/EN/10.12114/j.issn.1007-9572.2022.0007
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
痤疮丙酸杆菌 | 187 | 42(27.4) |
表皮葡萄球菌 | 117 | 33(21.6) |
人葡萄球菌 | 240 | 32(20.9) |
丙酸杆菌a | 40 | 10(6.5) |
金色黏液棒杆菌 | 67 | 5(3.4) |
溶血葡萄球菌 | 43 | 4(2.6) |
棒杆菌a | 24 | 4(2.6) |
藤黄微球菌 | 3 | 4(2.6) |
葡萄球菌属 | 7 | 2(1.3) |
沼泽库克菌 | 3 | 2(1.3) |
其他 | — | 15(9.8) |
合计 | — | 153(100.0) |
Table 1 The distribution of Gram-positive bacteria detected by use of mNGS technology
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
痤疮丙酸杆菌 | 187 | 42(27.4) |
表皮葡萄球菌 | 117 | 33(21.6) |
人葡萄球菌 | 240 | 32(20.9) |
丙酸杆菌a | 40 | 10(6.5) |
金色黏液棒杆菌 | 67 | 5(3.4) |
溶血葡萄球菌 | 43 | 4(2.6) |
棒杆菌a | 24 | 4(2.6) |
藤黄微球菌 | 3 | 4(2.6) |
葡萄球菌属 | 7 | 2(1.3) |
沼泽库克菌 | 3 | 2(1.3) |
其他 | — | 15(9.8) |
合计 | — | 153(100.0) |
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
约翰逊不动杆菌 | 249 | 26(12.9) |
越南伯克霍尔德菌 | 4 582 | 20(9.9) |
乌汶克霍尔德菌 | 238 | 19(9.4) |
德氏食酸菌 | 51 | 15(7.4) |
琼氏不动杆菌 | 40 | 14(6.9) |
奥斯陆莫拉菌 | 72 | 13(6.4) |
Methylorubrum extorquens | 67 | 12(5.9) |
温和食酸菌 | 48 | 10(5.0) |
食酸菌属 | 21 | 7(3.5) |
洛菲不动杆菌 | 168 | 6(3.0) |
其他 | — | 60(29.7) |
合计 | — | 202(100.0) |
Table 2 The distribution of Gram-negative bacteria detected by use of mNGS technology
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
约翰逊不动杆菌 | 249 | 26(12.9) |
越南伯克霍尔德菌 | 4 582 | 20(9.9) |
乌汶克霍尔德菌 | 238 | 19(9.4) |
德氏食酸菌 | 51 | 15(7.4) |
琼氏不动杆菌 | 40 | 14(6.9) |
奥斯陆莫拉菌 | 72 | 13(6.4) |
Methylorubrum extorquens | 67 | 12(5.9) |
温和食酸菌 | 48 | 10(5.0) |
食酸菌属 | 21 | 7(3.5) |
洛菲不动杆菌 | 168 | 6(3.0) |
其他 | — | 60(29.7) |
合计 | — | 202(100.0) |
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
限制马拉色菌 | 69 | 28(70.0) |
马拉色菌属 | 3 | 2(5.0) |
德氏根霉 | 6 | 1(2.5) |
白色念珠菌 | 834 | 1(2.5) |
土霉菌 | 4 570 | 1(2.5) |
曲霉属 | 3 | 1(2.5) |
近平滑假丝酵母 | 3 | 1(2.5) |
球形马拉色菌 | 105 | 1(2.5) |
近平滑念珠菌 | 15 | 1(2.5) |
阿萨西毛孢子菌 | 123 053 | 1(2.5) |
比氏肠微孢子虫 | 6 | 1(2.5) |
聚多曲霉 | 4 | 1(2.5) |
合计 | — | 40(100.0) |
Table 3 The distribution of fungi species detected by use of mNGS technology
菌属(种) | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
限制马拉色菌 | 69 | 28(70.0) |
马拉色菌属 | 3 | 2(5.0) |
德氏根霉 | 6 | 1(2.5) |
白色念珠菌 | 834 | 1(2.5) |
土霉菌 | 4 570 | 1(2.5) |
曲霉属 | 3 | 1(2.5) |
近平滑假丝酵母 | 3 | 1(2.5) |
球形马拉色菌 | 105 | 1(2.5) |
近平滑念珠菌 | 15 | 1(2.5) |
阿萨西毛孢子菌 | 123 053 | 1(2.5) |
比氏肠微孢子虫 | 6 | 1(2.5) |
聚多曲霉 | 4 | 1(2.5) |
合计 | — | 40(100.0) |
病毒类型 | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
CMV | 595 | 26(26.8) |
各型细环病毒 | 23 | 19(19.6) |
EB病毒 | 307 | 13(13.4) |
人类β疱疹病毒6B型 | 209 | 6(6.2) |
人腺病毒14型 | 8 | 5(5.2) |
人腺病毒55型 | 42 | 5(5.2) |
人类α疱疹病毒1型 | 372 | 5(5.2) |
人多瘤病毒1型 | 2 838 | 4(4.1) |
人腺病毒B型 | 61 | 2(2.1) |
人腺病毒11型 | 3 | 2(2.1) |
人腺病毒E4型 | 1 | 2(2.1) |
人类β疱疹病毒7型 | 33 | 2(2.1) |
人类α疱疹病毒3型 | 4 849 | 1(1.0) |
人多瘤病毒7型 | 212 | 1(1.0) |
人腺病毒7型 | 1 | 1(1.0) |
人腺病毒12型 | 41 | 1(1.0) |
肝炎GB病毒C型 | 5 | 1(1.0) |
乙型肝炎病毒 | 23 | 1(1.0) |
合计 | — | 97(100.0) |
Table 4 The distribution of viral species detected by use of mNGS technology
病毒类型 | 平均序列 | 构成比 |
---|---|---|
CMV | 595 | 26(26.8) |
各型细环病毒 | 23 | 19(19.6) |
EB病毒 | 307 | 13(13.4) |
人类β疱疹病毒6B型 | 209 | 6(6.2) |
人腺病毒14型 | 8 | 5(5.2) |
人腺病毒55型 | 42 | 5(5.2) |
人类α疱疹病毒1型 | 372 | 5(5.2) |
人多瘤病毒1型 | 2 838 | 4(4.1) |
人腺病毒B型 | 61 | 2(2.1) |
人腺病毒11型 | 3 | 2(2.1) |
人腺病毒E4型 | 1 | 2(2.1) |
人类β疱疹病毒7型 | 33 | 2(2.1) |
人类α疱疹病毒3型 | 4 849 | 1(1.0) |
人多瘤病毒7型 | 212 | 1(1.0) |
人腺病毒7型 | 1 | 1(1.0) |
人腺病毒12型 | 41 | 1(1.0) |
肝炎GB病毒C型 | 5 | 1(1.0) |
乙型肝炎病毒 | 23 | 1(1.0) |
合计 | — | 97(100.0) |
检测方法 | 4种方法同时检测样本数(个) | 阳性样本数(个) | 阳性率(%) |
---|---|---|---|
mNGS技术 | 38 | 38 | 100.0 |
培养法 | 38 | 10 | 26.3 |
G/GM试验 | 38 | 13 | 34.2 |
PCR检测 | 38 | 7 | 18.4 |
Table 5 Detection results by use of mNGS technology and other three test methods
检测方法 | 4种方法同时检测样本数(个) | 阳性样本数(个) | 阳性率(%) |
---|---|---|---|
mNGS技术 | 38 | 38 | 100.0 |
培养法 | 38 | 10 | 26.3 |
G/GM试验 | 38 | 13 | 34.2 |
PCR检测 | 38 | 7 | 18.4 |
患者编号 | 送检前使用药物 | 调整用药病原体 | 调整用药情况 | 治疗效果 |
---|---|---|---|---|
25 | 利奈唑胺+美罗培南+卡泊芬净+两性霉素B+复方新诺明 | EB病毒 | 加用阿昔洛韦 | 好转 |
33 | 利奈唑胺口服混悬液+注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠+两性霉素B | 白色念珠菌 | 加用卡泊芬净+氟胞嘧啶 | 好转 |
16 | 无 | 乙型肝炎病毒 | 恩替卡韦 | 好转 |
35 | 注射用头孢他啶阿维巴坦钠+美罗培南+卡泊芬净+伏立康唑 | 土曲霉 | 卡泊芬净加量 | 欠佳 |
17 | 注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠+替加环素+卡泊芬净 | 曲霉属 | 伏立康唑 | 欠佳 |
46 | 注射用头孢他啶阿维巴坦钠+替加环素+卡泊芬净 | 嗜麦芽窄食单胞菌 | 加用米诺环素 | 好转 |
Table 6 Medications adjusted for seven patients by the mNGS technology detection results
患者编号 | 送检前使用药物 | 调整用药病原体 | 调整用药情况 | 治疗效果 |
---|---|---|---|---|
25 | 利奈唑胺+美罗培南+卡泊芬净+两性霉素B+复方新诺明 | EB病毒 | 加用阿昔洛韦 | 好转 |
33 | 利奈唑胺口服混悬液+注射用哌拉西林钠他唑巴坦钠+两性霉素B | 白色念珠菌 | 加用卡泊芬净+氟胞嘧啶 | 好转 |
16 | 无 | 乙型肝炎病毒 | 恩替卡韦 | 好转 |
35 | 注射用头孢他啶阿维巴坦钠+美罗培南+卡泊芬净+伏立康唑 | 土曲霉 | 卡泊芬净加量 | 欠佳 |
17 | 注射用头孢哌酮钠舒巴坦钠+替加环素+卡泊芬净 | 曲霉属 | 伏立康唑 | 欠佳 |
46 | 注射用头孢他啶阿维巴坦钠+替加环素+卡泊芬净 | 嗜麦芽窄食单胞菌 | 加用米诺环素 | 好转 |
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